В 1989 году он переехал в США, где начал работать в компании ID Two (сейчас IDEO San Francisco). Он оттачивал свое мастерство в течение семи лет, уделяя основное внимание компаниям Кремниевой долины, и вернулся в Японию в 1996 году. Он основал и возглавил токийский офис IDEO, создав базу консультантов по дизайну для японского отделения компании. В 2003 году он начал самостоятельную деятельность и основал компанию NAOTO FUKASAWA DESIGN.

Фукасава входит в число директоров компании 21_21 Design Sight. Он также входит в консультативный совет по дизайну Muji и является арт-директором компании Maruni. Фукасава был председателем премии Good Design Award с 2010 по 2014 год. В 2012 году входил в судейский комитет премии Брауна. Он входит в состав судейской коллегии премии Nikkei Shimbun, вручающей награды за выдающиеся продукты и услуги и входит в отборочный комитет премии Mainichi Design Award. В 2017 году он стал членом судейского комитета премии Loewe Craft Prize. Фукасава преподает на кафедре комплексного дизайна в Университете искусств Тама. В 2006 году совместно с Джаспером Моррисоном он запустил проект “Super Normal”. Он является пятым куратором Японского музея народных ремесел. Ему было присвоено звание Королевского промышленного дизайнера (Королевское общество искусств).